Berikut adalah 12 tim yang berhasil melangkah ke babak 12 besar Liga 3 Jateng 2023/2024:
Grup A:
Persik Kendal (juara Grup A)
Bina Sentra Semarang (runner-up Grup A)
Grup B:
PSIP Pemalang (juara Grup B)
Persab Brebes (runner-up Grup B)
Grup C:
PSIK Klaten (juara Grup C)
Unsa Asmi FC (runner-up Grup C)
Grup D:
PSDB Demak (juara Grup D)
Persiku Kudus (runner-up Grup D)
Grup E: